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Nature：肠菌通过抗原模拟"训练"T细胞，远程支援癌症免疫治疗Nature——[48.5]
① 背景与设计：为检验肠菌能否通过抗原模拟引发的交叉反应增强癌症免疫治疗，构建表达分节丝状菌（SFB）抗原的小鼠肿瘤模型，结合TCR测序及命运图谱等技术追踪T细胞动态。② 核心发现与意义：揭示了微生物驱动的跨组织免疫可塑性机制，即SFB通过抗原模拟机制，驱动肠道TH17细胞转化为肿瘤内促炎性TH1样效应细胞，重塑肿瘤微环境以提升抗PD-1疗效，为靶向菌群以增强癌症免疫治疗提供依据。③ 抗原依赖性疗效：抗PD-1治疗仅在小鼠定植SFB且肿瘤表达同源抗原时，才能显著抑制黑色素瘤、肺癌及结肠癌生长，且SFB定植时机影响疗效。④ 细胞来源与转化：单细胞TCR追踪及命运图谱证实，肿瘤内发挥抗癌功能的TH1样细胞（ex-TH17）源自肠道中被SFB诱导的TH17细胞。⑤ 微环境重塑机制：肠道来源的ex-TH17细胞在肿瘤微环境中高表达IFN-γ和TNF，促进抗原呈递及细胞毒性CD8+ T细胞的招募与功能成熟，从而解除免疫抑制。⑥ 必要性验证：条件性消融Il17a+ T细胞或清除CD4+/CD8+ T细胞，均废除SFB介导的抗PD-1增效作用。⑦ 免疫程序特异性：诱导Treg的肝螺杆菌即便在抗原匹配下也无法增强疗效，表明只有诱导特定促炎程序的共生菌才能转化为治疗获益。
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Microbiota-induced T cell plasticity enables immune-mediated tumour control
2026-01-14 , doi: 10.1038/s41586-025-09913-z
华南农大任文凯团队Nature子刊：肠菌产茶氨酸促进宿主分解BCAANature Microbiology——[19.4]
① 背景与设计：针对肠道菌群如何间接调控宿主支链氨基酸（BCAA）代谢的问题，本研究利用无菌猪/小鼠模型、粪菌移植、多组学分析及细胞实验进行机制探索。② 核心发现与意义：罗伊氏粘液乳杆菌通过其代谢产物L-茶氨酸，以表观遗传和翻译后修饰方式上调宿主支链氨基酸转氨酶（BCATs）表达，从而驱动BCAA分解代谢，揭示了肠道菌群改善BCAA升高相关代谢疾病的新途径。③ 菌株筛选：比较代谢组学与扩增子测序显示，肠道中乳杆菌属（特别是罗伊氏粘液乳杆菌）丰度与宿主血清BCAA水平显著负相关。④ 代谢物功能：细胞与动物实验证实，罗伊氏粘液乳杆菌衍生的L-茶氨酸能增强肠上皮细胞中BCATs（尤其是BCAT2）的表达及活性，并促进BCAA分解。⑤ 转录调控：L-茶氨酸通过抑制启动子区域的H3K27me3等组蛋白修饰和DNA甲基化，解除对BCAT2基因的转录抑制。⑥ 翻译后调控：L-茶氨酸还通过抑制BCAT2蛋白K230/K247/K378位点的泛素化修饰，增强其蛋白稳定性。⑦ 功能验证：敲除罗伊氏粘液乳杆菌的L-茶氨酸合成基因glnA后，其降低宿主血清BCAA水平的能力丧失，确证了该代谢物的核心作用。
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Gut microbiota-derived l-theanine promotes host branched-chain amino acid catabolism
2026-01-14 , doi: 10.1038/s41564-025-02236-9
Cell子刊：脂肪细胞图谱揭示，肠脂垂响应菌群信号调免疫Cell Metabolism——[30.9]
① 研究背景与设计：针对人类不同解剖部位白色脂肪组织功能异质性未明的问题，联合单细胞核测序与空间转录组学构建了肥胖个体皮下及四种内脏脂肪库的精细细胞图谱。② 核心发现与意义：定义了不同脂肪库独特的细胞架构与空间分层，发现紧邻结肠的肠脂垂脂肪组织通过富集特异性炎症脂肪细胞亚型以适应肠道微生物环境。③ 细胞异质性：多组学分析显示，肠脂垂脂肪库显著富集表达血清淀粉样蛋白A的脂肪细胞亚型（SAA1/SAA2high）以及各类髓系与淋巴系免疫细胞。④ 空间微环境：开发SENSE算法解析出脂肪生成的空间分层结构，发现CD55+间充质干细胞定位于内脏脂肪的间皮层或皮下脂肪的网状间质区。⑤ 分子机制：实验证实LPS与TNF-α通过激活NF-κB及STAT3信号通路，并配合启动子去甲基化，特异性诱导脂肪细胞高表达SAA1/SAA2。⑥ 免疫互作：重组SAA1蛋白处理可显著激活基质血管组分中的髓系细胞并驱动促炎基因表达，证实了由肠道菌群产物激发的局部“脂肪-免疫”旁分泌信号轴。
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Cytoarchitectural multi-depot profiling reveals immune-metabolic crosstalk in human colon-associated adipose tissue
2026-01-13 , doi: 10.1016/j.cmet.2025.12.008
南京鼓楼医院宋玉君等NC：细菌"搭便车"让癌细胞变软促转移，微流控芯片精准检测Nature Communications——[15.7]
① 背景与设计：针对瘤内细菌通过改变宿主细胞力学特性促进转移的问题，开发基于细胞变形能力分选的高通量微流控芯片LesM。② 核心价值：该平台利用细菌感染导致的细胞骨架重排特性，高效捕获高变形能力的循环肿瘤细胞（CTCs），建立了机械表型与微生物载荷的关联，为预测和预防远端转移提供了新的液体活检工具和干预策略。③ 致软机制：木糖葡萄球菌等细菌侵入乳腺癌细胞后，通过抑制RhoA-ROCK通路导致应力纤维解聚，显著降低细胞杨氏模量并增强变形能力。④ 分选验证：LesM利用流体力学L型陷阱拦截刚性细胞，而软化感染细胞可挤入微通道，其分选性能在体外及体内实验中得到验证，“带菌”的感染CTCs计数与肺转移风险显著正相关。⑤ 干预窗口：在荷瘤小鼠模型中，肿瘤切除前的抗生素治疗（而非术后）显著减少了血液中感染CTCs数量并抑制了肺转移定植。⑥ 临床相关性：对69例乳腺癌患者的血液筛查显示，远端转移患者的感染CTCs检出率及数量显著高于淋巴转移或无转移患者。
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A Mechanophenotyping chip for high-throughput detection of metastatic bacteria-infected circulating tumor cells
2026-01-08 , doi: 10.1038/s41467-025-68152-y
武汉协和蔡开琳/曹英豪等：厌氧消化链球菌保护肠癌抵抗铁死亡，纳米酶破局Advanced Science——[14.1]
① 背景与设计：为探究结直肠癌（CRC）肿瘤内微生物对铁死亡抗性的影响，结合临床样本、小鼠模型及负载抗生素的纳米酶进行机制与干预研究。② 核心发现：厌氧消化链球菌（P. anaerobius）及其代谢物吲哚-3-丙烯酸（IDA）驱动CRC抵抗铁死亡；负载林可霉素的铁基纳米酶能清除该菌并产生活性氧，协同逆转铁死亡抗性并激活抗肿瘤免疫。③ 菌促癌机制：患者肿瘤中厌氧消化链球菌富集；其代谢物IDA通过芳烃受体信号下调ACSL4、上调GPX4/FSP1，抑制肿瘤细胞脂质过氧化，从而阻断铁死亡，并促进CRC生长。④ 纳米药构建：合成具有过氧化物酶样活性的铁单原子/簇纳米酶，并通过物理吸附高效封装靶向性抗生素林可霉素，形成酸响应性释放的Linco@Fe-zyme。⑤ 双重抗肿瘤效应：体内外实验表明，Linco@Fe-zyme清除肿瘤内厌氧消化链球菌并降低IDA，同时催化产生活性氧驱动脂质过氧化，协同诱导铁死亡并抑制肿瘤生长。⑥ 免疫应答激活：铁死亡细胞释放ATP、HMGB1及CRT等损伤相关分子模式，促进树突状细胞成熟及CD4+/CD8+ T细胞肿瘤浸润，增强抗肿瘤免疫。
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Targeting Peptostreptococcus anaerobius with an Iron-Based Nanozyme Reverses Ferroptosis Resistance and Enhances Antitumor Immunity in Colorectal Cancer
2026-01-12 , doi: 10.1002/advs.202516272
武汉协和楚慧款等：携带kpsM的大肠杆菌如何加重药物性肝损伤？Journal of Advanced Research——[13]
① 问题与设计：针对药物性肝损伤（DILI）中肠道菌群作用机制不明的问题，通过患者队列分析与小鼠模型，解析携带kpsM基因的大肠杆菌的致病机理。② 核心发现：携带kpsM基因的大肠杆菌通过上调宿主肠上皮α1,2-岩藻糖基转移酶（Fut2），抑制牛磺酸吸收并减少保肝代谢物牛磺熊去氧胆酸（TUDCA）合成，从而加剧肝损伤。③ 临床关联：在DILI患者中，kpsM+大肠杆菌检出率随疾病严重程度（轻度至中重度）显著升高，且血浆牛磺酸水平相应降低。④ 致病验证：在肝损伤小鼠模型中，灌胃kpsM+大肠杆菌（而非kpsM敲除株）显著加重肝损伤及肠道屏障破坏，并驱动肠上皮Fut2表达上调。⑤ 机制解析：肠上皮特异性Fut2敲除小鼠能抵抗kpsM+大肠杆菌的加剧效应，其肝脏牛磺酸及抗炎胆汁酸TUDCA水平显著回升。⑥ 分子互作：Fut2蛋白通过岩藻糖基化修饰牛磺酸转运蛋白TauT，抑制其转运功能，从而阻断肠道牛磺酸向肝脏，减少TUDCA合成。
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Escherichia coli expressing the kpsM gene exacerbates drug-induced liver injury through up-regulating α1,2-fucosyltransferase and disturbing the host taurine metabolism-from animal models and clinical studies
2026-01-03 , doi: 10.1016/j.jare.2025.12.012
西农刘学波团队：超声辅助提取益生菌肽聚糖，不仅增产还改善功能Food Chemistry——[9.8]
① 背景与设计：针对细菌肽聚糖提取效率低及功能改性需求，优化了植物乳植杆菌的超声波辅助提取工艺，并从结构、抗褐变及抗炎活性三方面评估所得肽聚糖的功能。② 核心发现：超声波辅助提取显著提升肽聚糖产率并改善其物理特性，在不破坏其免疫调节活性的同时，提升了其作为天然抗褐变剂在果蔬汁中的应用潜力。③ 结构变化：300 W超声处理降低了肽聚糖颗粒尺寸，增加了表面孔隙率，并降低了其相对结晶度。④ 抗褐变效果：改性肽聚糖凭借多孔结构显著吸附褐变底物，有效抑制苹果、梨及藕汁色泽劣变，联合微波处理具有协同增效作用。⑤ 免疫调节：在LPS诱导的RAW264.7巨噬细胞模型中，改性肽聚糖显著下调IL-1β和IL-6的mRNA表达及蛋白分泌，且无细胞毒性。⑥ 构效关系：结构分析表明，超声物理改性未破坏肽聚糖核心化学骨架，确保了其作为功能性食品配料的生物安全性与活性。
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Ultrasound-assisted extraction of peptidoglycan from Lactiplantibacillus plantarum: Structural characterization, anti-browning enhancement, and immunomodulatory effects
2026-01-03 , doi: 10.1016/j.foodchem.2026.147852
Cell子刊：大肠癌420万单细胞图谱，揭示中性粒细胞为何关键Cancer Cell——[44.5]
① 图谱构建与设计：整合650名结直肠癌患者共427万单细胞数据，并补充低mRNA细胞、空间转录组与蛋白组等多模态图谱，绘制涵盖四大免疫表型的肿瘤微环境图谱。② 核心发现与意义：揭示了结直肠癌肿瘤相关中性粒细胞的高度异质性和空间组织，其不同功能亚群与基因型、患者预后和治疗抵抗相关，是潜在治疗靶点。③ 基因型驱动极化：患者来源类器官共培养证实，KRAS突变肿瘤信号驱动中性粒细胞向促肿瘤表型极化，上调OLR1表达并延长其存活。④ 亚群与预后：肿瘤组织中存在促肿瘤的IL-1A/B+和具有抗原呈递特征的HLA-DRA+中性粒细胞亚群，后者在肿瘤核心区的高密度与患者较好生存相关。⑤ 空间互作：空间分析揭示中性粒细胞富集生态位，其中中性粒细胞高表达IL-1B激活成纤维细胞IL-1R1信号，成纤维细胞则分泌CXCL趋化因子招募中性粒细胞。⑥ 骨髓重编程：小鼠原位模型证实肿瘤信号可改变骨髓粒细胞生成，且选择性耗竭肿瘤内促肿瘤Siglec-F+中性粒细胞能减轻CD4+ T细胞耗竭。
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Single-cell integration and multi-modal profiling reveals phenotypes and spatial organization of neutrophils in colorectal cancer
2026-01-12 , doi: 10.1016/j.ccell.2025.12.003
大肠息肉突变图谱，揭示差异化分子特征和起源Gastroenterology——[25.1]
① 背景与设计：针对无明确胚系致病变异的腺瘤性或锯齿状结直肠息肉病，对169名患者的299个肿瘤样本进行全外显子组测序以解析体细胞突变谱。② 核心发现与意义：揭示体细胞APC嵌合是未确诊息肉病的重要病因，且BRAF突变锯齿状息肉保留了类似正常组织的分子特征，提示良性克隆扩增机制。③ 驱动基因分型：腺瘤性息肉显著富集APC或CTNNB1突变，而锯齿状息肉主要由BRAF V600E驱动，且大多数息肉呈低肿瘤突变负荷及微卫星稳定状态。④ APC嵌合现象：在约19%的多肿瘤测序腺瘤性息肉病患者中鉴定出体细胞APC嵌合，填补了部分“不明原因”病例的遗传学空白。⑤ 突变特征差异：与散发性结直肠癌相比，APC/CTNNB1突变息肉的SBS1时钟样特征贡献显著降低，提示其处于肿瘤发生早期阶段。⑥ 良性起源提示：BRAF突变锯齿状息肉表现出与正常结肠上皮高度相似的SBS89突变特征，提示其可能为具备有限恶性潜能的单纯克隆性扩增。
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Mutational Landscape of Colorectal Tumors From Individuals With Unexplained Adenomatous or Serrated Colorectal Polyposis
2026-01-12 , doi: 10.1053/j.gastro.2025.10.011
中山医院许剑民团队：PD-L1+TIGIT双免疫治疗，提升MSS直肠癌放化疗后完全缓解率Journal of Clinical Oncology——[41.9]
① 背景与设计：针对pMMR/MSS局部晚期直肠癌新辅助放化疗后病理缓解率不足的问题，采用随机II期试验设计评估了长程放化疗后序贯阿特珠单抗（PD-L1抑制剂）联合或不联合Tiragolumab（TIGIT抑制剂）的疗效与安全性。② 总体概述：双重免疫检查点阻断（PD-L1+TIGIT）策略显著提升了病理完全缓解率，且安全性可控，提示放疗可能通过免疫调节增强pMMR/MSS肿瘤对免疫治疗的敏感性。③ 主要疗效：阿特珠单抗联合Tiragolumab组病理完全缓解率达35.7%，显著优于历史对照（15%）；阿特珠单抗单药组缓解率为22.2%，虽有数值提升但未达统计学显著差异。④ 生物标志物：探索性分析提示PD-L1表达与联合治疗的病理响应存在正相关趋势，且放化疗可能促进了肿瘤微环境中PD-L1的上调。⑤ 生存获益：联合治疗组表现出优异的近期生存数据，1年无事件生存率达96.3%，且所有接受手术的患者均实现了显微镜下切缘阴性（R0）切除。⑥ 安全性评价：两组3-4级治疗相关不良事件发生率相近，其中免疫相关特定不良事件发生率仅约为10%，未发生治疗相关死亡。
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Randomized Parallel-Group Phase II Study (NEOTERIC) of Atezolizumab With or Without Tiragolumab After Neoadjuvant Chemoradiotherapy in Locally Advanced Rectal Cancer
2026-01-13 , doi: 10.1200/JCO-25-01883
NC：双靶向治疗有效改善难治性HER2阳性肠癌生存Nature Communications——[15.7]
① 背景与设计：II期MOUNTAINEER试验评估图卡替尼联合曲妥珠单抗在经治HER2阳性、RAS野生型转移性结直肠癌患者中的疗效与安全性。② 核心发现与意义：该无化疗双重HER2靶向方案在延长随访中展现出持久的临床缓解与生存获益，可作为该类难治性患者标准治疗方案。③ 最终疗效：中位随访32.4个月，确认客观缓解率39.3%，中位缓解持续时间15.2个月，中位无进展生存期8.1个月，中位总生存期23.9个月。④ 安全性：最常见治疗相关不良事件为腹泻、疲劳和恶心，多数为低级别，因毒性导致的停药率低且无治疗相关死亡发生。⑤ 检测方法：组织免疫组化/荧光原位杂交、组织与血液二代测序三种中心HER2检测方法一致性较高，且各方法确定的HER2阳性患者疗效相似。⑥ 生物标志物：ERBB2高拷贝数及高着丝粒比值与较高缓解率相关，而基线共突变（如PIK3CA）未显示与原发性耐药存在明确关联。⑦ 耐药机制：循环肿瘤DNA分析提示，疾病进展时常见获得性KRAS/NRAS、PIK3CA及受体酪氨酸激酶基因改变，但绝大多数患者仍保留ERBB2扩增。
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Tucatinib plus trastuzumab for chemotherapy-refractory, HER2 + , RAS wild-type metastatic colorectal cancer (MOUNTAINEER): final analysis
2026-01-12 , doi: 10.1038/s41467-025-67824-z
Nature子刊：低成本改装普通马桶，智能监测便便健康Nature Protocols——[16]
① 核心技术概述：本文介绍了名为PHIND系统的低成本智能马桶构建方案，通过集成传感器与深度学习技术，实现对用户排便情况的无创、被动及连续监测。② 硬件组装流程：该协议详述了将光学与压力传感器安装于标准马桶座圈、并将冲水按钮替换为指纹扫描仪的134个步骤，以此实现自动化数据采集与用户身份绑定。③ AI模型训练：研究指导如何训练卷积神经网络（CNN）模型，通过分析粪便图像实现Bristol量表分类及便秘、腹泻等健康状态判定，准确率可达86%至98%以上。④ 云端分析架构：系统利用亚马逊网络服务（AWS）构建后端，集成S3存储与EC2计算实例进行实时推理，硬件成本约100美元，云运行成本低廉且易于扩展。⑤ 数据隐私保护：方案强调“隐私设计”原则，指纹数据仅在本地处理，图像数据经加密传输，并严格界定了知情同意与伦理审查流程以规避法律风险。⑥ 临床应用价值：相比存在回忆偏差的传统患者日记，该系统能提供客观、纵向的“数字生物标志物”，辅助炎症性肠病等胃肠道疾病的早期检测与长期管理。⑦ 局限与展望：当前系统尚无法进行微生物或生化分析，且原型机需进一步优化防水与抗冲击设计，研究团队已开源代码以促进系统的改进与更广泛的部署。
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Deployment of a cloud-based passive defecation monitoring system for continuous gut health monitoring
2026-01-09 , doi: 10.1038/s41596-025-01296-9
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